https://frosthead.com

Биотехническа компания в Бостън създава нови миризми

Ginkgo Bioworks се обслужва от хакери. Въпреки че предпочитат да казват, че „проектират организми“, служителите са изградили лаборатория или „леярна“ в Бостън, където хакнат биологията. Те сплитат гени, след което вмъкват смеси от гени във флакони с мая, за бързо отглеждане на синтетични организми, които обслужват човешките нужди .

Креативният директор на Gingko, Кристина Агапакис, казва, че те по същество се занимават с ускоряване на еволюцията. „Това е като фабрика за бързо създаване на прототипи“, казва тя.

Биокекерите работят върху изграждането на организми, които улавят въглерода и други, които отглеждат пробиотици, които помагат на хората да се борят с инфекциите. Компанията получи първоначално финансиране от DARPA за разработването на последната. Но в момента Gingko създава организми, които излъчват специфични миризми. Целта е да се произвеждат масово синтетични аромати и аромати, които могат да се използват за всичко - от парфюм до изкуствен подсладител. Това е стъпка към потенциално заместване на редки, скъпи, бавнорастящи или летливи органични съединения. Robertet, френска компания за аромати, възложи на Gingko да помогне за синтезирането на аромат от специфична роза, отглеждана само в Турция и България, която трудоемко се бере на ръка.

„Ароматът е водещ, защото ароматът използва химията на нещо, което започна като биологичен екстракт“, казва тя. „Затова разглеждаме къде биологията може да се върне в химическото инженерство и да я направи устойчива и възобновяема.“

Наскоро говорих с Agapakis за компанията и нейната мисия:

Как Гинко започна старта си?

Ginkgo е основана през 2008 г. от Том Найт и четирима момчета (Решма Шетти, Джейсън Кели, Бари Кантон, Остин Ч), които току-що завършиха докторантурата си в MIT. Том имал ръка в разработването на ARPANET, предшественик на Интернет, но в края на 90-те реши, че компютрите са скучни и биологията на програмирането е интересна. Той искаше да види къде инженерството и биологията могат да се пресичат. Това беше смисълът на Гинко. Основателите искат да направят биологията по-лесна за инженерство, а след това да разгледат какво означава това за индустрията и технологиите.

Защо се случва сега?

Когато започнаха през 2008 г., беше точно времето, когато цената на последователностите на ДНК наистина бързо спадаше и поради това хората започнаха да секвенират всичко. Знанията за това как еволюцията е решила проблемите бързо се разширяват и хората са секвенирали всякакви геноми и ензими. Тя се е превърнала в ресурс или библиотека.

Другата страна на нещата е синтез. Някога трябваше да намираш организмите, а сега можеш да синтезираш гени от базата данни. Когато бях студент, тя струваше 1 долар за базова двойка, така че ген струваше от един до 5000 долара. Сега тя се свежда до стотинки на база. Просто поставихме поръчка за 100 милиона базови двойки от Twist [компания за синтетични ДНК], което е достатъчно, за да напишем генома на дрождите 10 пъти. Става много по-възможно.

Кристина-Agapakis-2.jpg Кристина Агапакис, креативен директор в Бинкс Гинко (Снимка от Тачър Кук за PopTech)

Какво точно правите в лабораторията?

Това е като фабрика за бързо прототипиране. Можем да пуснем много варианти на различни пътища и да видим какво работи в правилната комбинация.

Понякога нашите проекти започват с нашите клиенти. Те ще кажат: „Трудно ни е да направим тази съставка“ и ще започнем да търсим организъм, който да произведе нещо за тях. Започваме от биохимията. Ние имаме технически инженери, които разбират биологията на клетките и всички метаболити, които са там, така че те разбират как процесите влияят върху клетките.

Други видове проекти разглеждат какво може да направи биологията в химическото пространство. [Ето къде е Гинко отглеждане на микроби, които да имитират миризмата на тази трудно отглеждаща роза.] За съставките, които разглеждаме сега, или цветята или растенията като цяло, има няколко класа химикали, които могат да направят различни клетки. Казват, че 1000 до 5000 различни ензими. Ще кажем, нека ги синтезираме и сложим в мая и да видим какво правят вариантите.

Защо използвате мая като основен материал?

Дрождите са страхотни, защото ние като хората наистина сме добри в ферментирането на мая. Има много технологии около способността на дрождите да създават аромати и миризми, заради бирата. Това, което правим е наистина готин микс от съвременна наука и традиционни методи за варене. Нашата глава на ферментацията всъщност притежава пивоварна - Mystic Brewery в Челси [Масачузетс].

Предимството на леярната е, че може да автоматизира последователността. Предимството на леярната е, че може да автоматизира последователността. (Ginkgo Bioworks)

Над какво работиш сега?

Има постоянно развиваща се диаграма на Venn за това къде се намират възможностите на биологията, къде инженерството е възможно и къде има индустрия, нужди и технологии. Ароматът е водещ, но ние също работим върху технологията за улавяне на въглерод. Получихме безвъзмездна помощ от Агенцията-Енергия (ARPA-E) за разширени научноизследователски проекти, за да разгледаме улавянето на въглерод и превръщането на късоверижните въглероди в по-сложни неща. Ние също работим с Ajinomoto, японска компания за хранителни и химически продукти, за да видим дали можем да намерим начини да подобрим техния поток от отпадъци.

Какво се случва след това?

Bioworks 2, разширена леярна, се отваря през пролетта или началото на лятото на следващата година, а леярна постоянно повтаря. Винаги мислим за дизайна на организма и как да го управляваме по-ефективно. Привличаме нови проекти, клиенти и пазари, но работим и върху технологиите.

Десет години навън, ние разглеждаме микробиома, микробните общности и как можем да проектираме микробите. Очаквам с нетърпение време, когато знаем как микробите работят заедно. Също така мислим за всички неща, които миришат. Някой ден искаме да имаме нещо, наречено „100-те флакона“. Това биха били 100 различни миризми, които се създават чрез природата.

Биотехническа компания в Бостън създава нови миризми