https://frosthead.com

Как да си направим додо

Бележка на редактора, 22 септември 2009 г .: Бет Шапиро е един от двадесет и четири лица, избрани за сътрудник на MacArthur през 2009 г. от фондацията Джон Д. и Катрин Т. Макартур. Тя ще получи „гениална помощ“ от 500 000 долара.

Свързано съдържание

  • Млади иноватори в изкуствата и науките
  • Последната дума

Ако се опитвате да изолирате додо ДНК, изпълнете следните стъпки: първо намерете додо кост, която не е вкаменена. Това трябва да е лесно. Сред малкото известни в света са череп и ляв крак, които се съхраняват в кутии на втория етаж на Природонаучния музей на Оксфордския университет. Те са във владение на университета от 1683 г., около времето, когато загина последното додо. Не е голям музей, но ако се изгубите, потърсете малка плоча до входа на склад, където през 1860 г. се проведе легендарен дебат за теорията на еволюцията на Чарлз Дарвин.

Трудната част, както откри биологът Бет Шапиро през 2000 г., ще убеди мениджъра на колекциите Malgosia Nowak-Kemp да ви позволи да направите тренировка за крайния невъзобновяем ресурс. Вярно е, че няма да е необходимо да унищожавате много - фрагмент с големина на пинк нокът трябва да е достатъчен - но е безопасно да се каже, че няма да получите втори шанс. Опитайте се да не позволявате на натиска да стигне до вас. "Ето този много известен екземпляр, много ограничен ресурс. Влиза къс американец и иска да извади парче от него", казва Шапиро. "[Ноуак-Кемп] не беше почти толкова уплашен, колкото аз."

Следващата стъпка е полимеразна верижна реакция. Използван за всичко - от тестовете за бащинство до клонирането, PCR изисква добре оборудвана лаборатория. Преди да влезете вътре, облечете чист костюм, като тези, открити във фабриките за компютърни чипове, за да не замърсите пробата си с модерна ДНК.

Готов? ОК: смиламе костта на додо до фин прах. Разтворете го във воден разтвор. Смесете в магнезий и ДНК полимерази - ензими, които помагат на гените да правят копия от себе си. Загрейте сместа до около 150 градуса по Фаренхайт, за да разкъсате ДНК вериги на две нишки. Охладете го, като оставите ензимите на полимераза да се придържат към ДНК на Додо и да създадете копия от него. Повторете поне 30 пъти. До сутринта трябва да имате епруветка с около милион копия на додо ген или генен фрагмент.

За Шапиро, на 31 години, тази измамно проста звучаща процедура се оказа рецепта за успех. Когато пристига в Оксфорд като учен на Родос през 1999 г., тя се учени при Алън Купър, пионер в чисто новата област на древната ДНК. За шестте години оттогава Шапиро се издигна на върха на малката, високопрофилна, преобладаващо млада общност от изследователи на древни ДНК. Наскоро тя прие работа в Penn State, където ще започне да преподава тази есен.

Древните ДНК изследвания анализират гените на отдавна умрели растения и животни - оставяйки на учените да проследят еволюцията и изчезването на видове с точност, невъобразима само преди пет години. Сравнявайки например ДНК на додо с гените на пет други вида, например, изследванията на Шапиро установяват, че птицата без полет е далечна роднина на гълъба. Докладът ѝ от 2004 г. в „ Наука“ твърди, че спадът на бизоните е започнал много по-рано от предполагаемото - преди около 37 000 години - и по този начин не е причинен предимно от ловуващите хора в Северна Америка. Миналата година проучване, в което тя си сътрудничи за генома на мамут, даде улики за най-близкия му жив роднина (слона, изненадващо).

Преди две години, след като замени Купър като ръководител на Центъра за древни биомолекули на Хенри Уелком в Оксфорд, Шапиро започна да слага собствен печат в лабораторията. Съвсем наскоро тя започна да проследява мутациите в вируса на СПИН - нещо като еволюционно проучване в бързи крачки. "Тя преминава много граници", казва изследователят на древните ДНК Иън Барнс от Royal Holloway, University of London. "Тя се смята за един от най-добрите хора в тази област по отношение на способността й да управлява много различни изследвания."

Преминаването на граници е любим режим. Докато е още в гимназията, Шапиро работи като амбициозен журналист за телевизия в Рим, Джорджия. В колежа тя се спря на мандаринска китайска, геология, испанска и английска литература, след което се настани на специалност по екология. Тя получи докторска степен по еволюционна биология от Оксфорд само за три години - и все още намери време да оглави винения клуб на университета и да бъде домакин на научно шоу за местно радио.

Шапиро обиколи света в търсене на ДНК проби, древни и други. Повечето са били много по-трудни за намиране от костта на Додо. В канадската територия Юкон тя попадна в 800-годишна карибушка тор, докато събираше проби за тестване; в Кения тя избягва лъвове, за да грабне зебра. Тя е събрала вълнени кости на мамут от Сибир, а останките от бизони от Аляска. Миналото лято тя лети до остров Мавриций в Индийския океан, за да търси нефосифицирани кости от додо, за да се сравни с образеца от Оксфорд - безуспешно.

Подобно на много от колегите си, Шапиро парира много въпроси относно клонирането; идеята за повторно създаване на изчезнал вид е просто толкова мъчителна. Но има огромни технически предизвикателства, които учените тепърва трябва да преодоляват: древната ДНК има тенденция да влиза в много малки фрагменти и без живо животно няма начин да се реконструира кои гени влизат в игра на кои етапи от развитието на додото. Накратко: без мадо додо, без додо бебе.

Но по-важното е, че тя поставя въпроса дали връщането на видовете в свят, където те нямат местообитание, има смисъл. „Разбира се, секси и с висок профил е да се говори за клониране на изчезнали видове“, казва тя, „но има много по-важни приноси, които могат да бъдат направени. . " Вместо това тя ще продължава да се опитва да разбере защо някои видове изчезнаха. Тя се надява, че нейните изследвания могат да помогнат да се предотврати преминаването на съвременните видове по пътя на додото.

Андрю Къри пише за нарисуваните румънски манастири в юнския брой на Smithsonian. Живее в Берлин.

Как да си направим додо