https://frosthead.com

Tardigrades Стимулира спор и демонстрира наука в действие

Няма съмнение, че микроскопичните водни безгръбначни, известни като тардигради, мъхови прасенца или водни мечки, са странни. Странно прелестните същества могат да преживеят вакуума на космоса, да издържат сушенето чрез суша и да се появят живи след замръзване, сред другите подвизи. Скорошно проучване сочи, че тардиградите също са генни крадци - че техните геноми държат повече ДНК от несвързани растения, бактерии и други микроби, отколкото всяко друго животно на Земята, неотдавна Рейчъл Нууър съобщи за Smithsonian.com . Тази способност може дори да обясни защо тардиградите са толкова устойчиви, предполагат изследователите.

Но около седмица след обявяването на това изненадващо откритие друга група оспорва откритията, съобщава Ed Yong за The Atlantic . Бързото връщане назад между двата екипа демонстрира колко отзивчива и потенциално самокорегираща наука може да бъде в цифровата епоха.

Първото проучване, проведено от екип, базиран в Университета на Северна Каролина, съобщава, че един tardigrade вид притежава огромни 6 600 гена, които първоначално са принадлежали на организми от други кралства - предимно бактерии, но също така и гъби, растения, вируси и археи, и придобити чрез процес, наречен хоризонтален трансфер на ген. Тези открития означават, че геномът на Hypsibius dujardini е съставен от около 17, 5 процента чуждестранна ДНК, съобщи екипът в Proceedings of the National Academy of Sciences . Тъй като някои от чуждите гени са замесени в стресовите реакции на други организми, изследователите подозират, че може би са подарили тардигради с някои свои собствени уникални способности за атмосферни екстремни условия.

Втора група от Университета в Единбург също секвенира същите тардиградни видове и получи много различни резултати. Тези изследователи откриха, че клитерът има между 36 и 500 хоризонтално прехвърлени гени - много по-малък процент. Когато излезе хартията на UNC, резултатите от Единбург все още не бяха публикувани, но изследователите изтърсиха да публикуват своите открития на сървъра за отпечатване bioRxiv.org - уебсайт, където ръкописите могат да бъдат публикувани, преди да бъдат изпратени в списание и партньорската проверка, характерна за научно изследване.

Единбургската група подозира, че групата на UNC може да има "секвенирана ДНК от бактерии, които са живели покрай тардиградите и въпреки най-добрите си усилия, са сбъркали гените на тези микроби за истински тардиградни гени", пише Йонг. Но как първата група можеше да сбърка, ако наистина е така? Йонг обяснява, че технологията за секвениране на геноми включва нарязване на ДНК на малки парченца и след това повторно сглобяване на битовете в съгласувана картина. Някои замърсявания могат лесно да се изплъзнат, така че учените полагат усилия да установят кои парченца принадлежат на организма, който изучават, а не на микроби в близост.

Единбургската група разбрала, че някои от фрагментите на ДНК са редки, в сравнение с други фрагменти. "Няма как, биологично, те могат да бъдат част от един и същ геном", казва лидерът на екипа Марк Блексър за Йонг. Групата заключи, че в генома на тардиграда има 500 гена, които биха могли да дойдат от други източници, но за 36 от тях има само категорични доказателства. Това дава на тардиграда много по-типична пропорция на чужда ДНК за животно.

В коментар към най-новата книга Томас Бутби и Боб Голдщайн от UNC изтъкват, че са били наясно с този потенциален проблем и са работили усилено, за да гарантират, че той няма да повлияе на техните резултати - но винаги има възможност за грешка. Те добавят, че ще направят допълнителен анализ, преди да направят допълнителен коментар. Изследователите също така заявиха, че оценяват решението на техните съперници да публикуват толкова бързо противоречивите си резултати на bioRxiv.org .

Чувствата бяха взаимни. Суджай Кумар от екипа на Единбург каза на Йонг, че ако групата на ООН не беше пуснала данните си своевременно, това би било по-предизвикателно за тяхната група. "Това, което е очевидно, е удивителната нова способност на науката да се самокоригира бързо", казва Блексър на Йонг. Това, което в този случай отне само девет дни, щеше да отнеме месеци в миналото.

Засега журито все още не е в това, каква част от генома на тардиграда идва от чужди източници. Но дори и тези мънички същества да не са генни крадци, те могат да бъдат крадци на заглавие за известно време.

Забележка на редактора: Тази статия е редактирана от Рейчъл Нууер, която първоначално е докладвала за проучването на tardigrade за Smithsonian.com.

Tardigrades Стимулира спор и демонстрира наука в действие